造成甲减的原因多种多样，有不可避免、不可预防的遗传因素，也有一些是术后所造成。常见于进行甲状腺专业方式的解决的甲亢病人，因为如果专业方式切除甲状腺组织过少，可以造成甲亢的复发，但切除过多会造成甲状腺功能的减低，也就是甲减。
此外使用碘-131进行解决的甲亢他，解决过程中如果剂量不足会造成甲亢的复发，但剂量过多甲减的几率就会增多，所以50%以上的他，经过五年到十年之后都会出现甲减的症状。甲减还可由于年龄的因素、器官的老化导致甲状腺分泌甲状腺素不足，以造成甲减。
还有垂体问题可以造成甲减，例如垂体瘤、垂体的其它的病变，造成垂体的甲状腺轴受损，临床上表现为甲减的症状，它的解决方法也是用甲状腺素片替代解决。中枢新甲减的辅助检测上可以表现为T3、T4、TSH的全面降低，它与原发新甲减和继发新甲减的观察指标不同。临床上由于孕妇的特殊状态，TSH指标通常控制在一定程度，所以对于某些数值正常的孕妇，也可以诊断为妊娠合并甲减。
